Hvad bruges NCBI BLAST til?
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) finder regioner med lokal lighed mellem protein- eller nukleotidsekvenser. Programmet sammenligner nukleotid- eller proteinsekvenser med sekvens i en database og beregner den statistiske signifikans af matches.
Er NCBI BLAST en software?
I 1990 udgav forskere ved National Center for Biotechnology Information (NCBI) en ny softwarepakke til hurtig sammenligning af DNA og proteinsekvens [15].
Hvordan finder du BLAST?
BLAST sekvens lighed søgning
- Vælg fanen 'Blast' på værktøjslinjen øverst på siden for at køre en sekvenslighedssøgning med Blast -programmet.
- Indtast enten en protein- eller nukleotidsekvens eller et UniProt -id i formfeltet (Figur 37).
- Klik på knappen 'Kør sprængning'.
Hvad er NCBI GenBank?
GenBank® er en omfattende database, der indeholder offentligt tilgængelige nukleotidsekvenser for mere end 300 000 organismer navngivet på slægtsniveau eller lavere, primært opnået via indsendelser fra individuelle laboratorier og batchindleveringer fra storstilet sekventeringsprojekter, herunder hele genom-haglgevær ( ...